ในวันที่ 24 พฤษภาคม 2559 โรงเรียนหนองนาคำวิทยาคม รับการประเมินโครงการสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน เพื่อรับป้ายโดยได้รับเกียรติจาก คณะกรรมการสถาศึกษาขั้นพิ้นฐาน ผู้นำชุมชน ร่วมเป็นสักขีพยาน และให้กำลังใจ ซึ่งโครงการอนุรักษ์พันธุกรรมพืชอันเนื่องมาจากพระราชดำริ สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯสยามบรมราชกุมารี ได้ดำเนินงานสนองพระราชดำริ จัดตั้งงาน “สวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน” เพื่อเป็นสื่อในการสร้างจิตสำนึกด้านอนุรักษ์พันธุกรรมพืช โดยให้เยาวชนนั้นได้ใกล้ชิดกับพืชพรรณไม้ เห็นคุณค่า ประโยชน์ความสวยงาม อันจะก่อให้เกิดความคิดที่จะอนุรักษ์พืชพรรณต่อไป และได้จัดการประชุมเพื่อเผยแพร่พระราชดำริและแนวทางการดำเนินงานสวนพฤกษศาสตร์-โรงเรียนให้กับโรงเรียนที่สนใจ สมัครใจที่จะร่วมสนองพระราชดำริ